Polymeras är ett enzym (EC 2.7.7.6/7/19/48/49) som syntetiserar långa kedjor av polymerer eller nukleinsyror. DNA-polymeras och RNA-polymeras används för att sätta ihop DNA-respektive RNA-molekyler genom att kopiera en DNA-mallsträng med basparande interaktioner eller RNA genom halvstegsreplikation.
Ett DNA-polymeras från den termofila bakterien, Thermus aquaticus ( Taq ) (PDB 1BGX , EC 2.7.7.7) används i polymeraskedjereaktionen, en viktig teknik inom molekylärbiologin.
Ett polymeras kan vara mallberoende eller malloberoende. Poly-A-polymeras är ett exempel på malloberoende polymeras. Terminalt deoxinukleotidyltransferas är också känt för att ha både malloberoende och mallberoende aktiviteter.
Typer Efter funktion + Klasser av mallberoende polymerasDNA-polymerasRNA-polymerasMallen är DNADNA-beroende DNA-polymeras eller vanliga DNA-polymeraserDNA-beroende RNA-polymeras eller vanliga RNA-polymeraserMallen är RNARNA-beroende DNA-polymeraseller omvänt transkriptasRNA-beroende RNA-polymeraseller RdRp eller RNA-replikas
DNA polymerase (DNA-riktat DNA-polymeras, DdDP) Familj A: DNA polymeras I; Pol γ, θ, ν Familj B: DNA polymeras II; Pol α, δ, ε, ζ Familj C: DNA polymeras III holoenzym Familj X: Pol β, λ, μ Terminal deoxynucleotidyl transferase (TDT), som ger mångfald åt antikroppars tunga kedjor. Familj Y: DNA polymeras IV (DinB) och DNA-polymeras V (UmuD'2C) - SOS reparationspolymeraser; Pol η, ι, κ Omvänt transkriptas (RT; RNA-riktat DNA polymeras, RdDP) Telomeras DNA-riktat RNA-polymeras (DdRP, RNAP) Multiunderenhet (msDdRP): RNA-polymeras I, RNA-polymeras II, RNA-polymeras III Enkelunderenhet (ssDdRP): T7 RNA polymeras, POLRMT Primase, PrimPol RNA-replikas (RNA-riktat RNA-polymeras, RdRP) Viral (enkelunderenhet) Eukaryot cellulär (cRdRP, dubbelunderenhet) Mallfri RNA-förlängning Polyadenylering: PAP, PNPas
Efter struktur Polymeraser är i allmänhet uppdelade i två superfamiljer, "högerhands" veckade (InterPro : IPR043502) och "dubbel psi beta barrel" (ofta helt enkelt "double-barrel") veckade. Den förra ses i nästan alla DNA-polymeraser och nästan alla virala enkelunderenhetspolymeraser. De är markerade med en bevarad "palm"-domän. Det senare ses i alla RNA-polymeraser med flera underenheter, i cRdRP, och i "familj D"-DNA-polymeraser som finns i archaea. "X"-familjen som representeras av DNA-polymeras beta har bara en vag "handflata"-form och anses ibland vara en annan superfamilj (InterPro : IPR043519 ).
Primaser faller i allmänhet inte in i någon av kategorierna. Bakteriella primaser har vanligtvis Toprim-domänen, och är relaterade till topoisomeraser och mitokondriell helicase -glitter. Archae- och eukaryotaprimaser bildar en obesläktad AEP-familj, möjligen besläktad med polymeraspalmen. Båda familjerna är ändå bundna till samma uppsättning helikaser.
Se även Centrala dogmen Exonukleas Ligas Nukleas PCR RT-PCR
Referenser
Noter
Externa länkar
Kategori:Enzymer