Stor-Ysjön kan syfta på ett antal insjöar i Sverige:
Stor-Ysjön (Junsele socken, Ångermanland), sjö i Sollefteå kommun, (53,5 ha) Stor-Ysjön (Vibyggerå socken, Ångermanland), sjö i Kramfors kommun, (25,8 ha)
Se även Ysjön
Kategori:Listor över Sveriges insjöar baserat på namn