Lista över Estlands floder följer nedan.
Nr FlodTotal längd, sträckan i Estland kan variera. Längd Flodbäcken Landskap Avrinningsområde Anmärkning VEE-kod 1. Gauja (Koiva jõgi) 452 9080 Valgamaa Rigabukten Rinner i Lettland, gränsflod till Estland. 1154200 2. Võhandu jõgi 165 1402 Põlvamaa, Võrumaa Finska viken ← Narva ← Peipus 1003000 3. Pededze (Pedetsi jõgi) 159 1690 Võrumaa Rigabukten ← Daugava ← Aiviekste Merparten i Lettland. 1159700 4. Pärnu 145 6837 Pärnumaa, Järvamaa Rigabukten 1123500 5. Põltsamaa jõgi 136 1297 Jõgevamaa, Viljandimaa, Lääne-Virumaa, Järvamaa Finska viken ← Narva ← Peipus ← Emajõgi ← Pedja jõgi 1030000 6. Pedja jõgi 125 2688 Jõgevamaa, Viljandimaa, Lääne-Virumaa, Tartumaa Finska viken ← Narva ← Peipus ← Emajõgi 1023700 7. Kasari jõgi 115 3213 Läänemaa, Raplamaa, Harjumaa, Pärnumaa Moonsund 1107000 8. Keila jõgi 112 669 Harjumaa, Raplamaa Finska viken 1096100 9. Piusa 109 796 Võrumaa Finska viken ← Narva ← Peipus Mynningen ligger i Ryssland. 1000200 10. Pirita jõgi 107 808 Harjumaa Finska viken 1089200 11. Ahja jõgi 104 1074 Tartumaa, Põlvamaa Finska viken ← Narva ← Peipus ← Emajõgi 1047200 12. Õhne jõgi 102 573 Viljandimaa, Valgamaa Finska viken ← Narva ← Peipus ← Emajõgi ← Võrtsjärv Rinner även i Lettland. 1013700 13. Navesti jõgi 102 3004 Pärnumaa, Viljandimaa, Jõgevamaa, Järvamaa Rigabukten ← Pärnu 1131600 14. Emajõgi 99 9628 Tartumaa, Viljandimaa Finska viken ← Narva ← Peipus 1023600 15. Jägala jõgi 99 1481 Harjumaa, Järvamaa Finska viken 1083500 16. Vigala jõgi 97 1577 Pärnumaa, Raplamaa Moonsund ← Kasari jõgi 1110400 17. Halliste jõgi 92 1891 Pärnumaa, Viljandimaa Rigabukten ← Pärnu ← Navesti jõgi 1136000 18. Valgejõgi 90 452 Harjumaa, Lääne-Virumaa Finska viken 1079200 19. Väike Emajõgi 87 1290 Valgamaa Finska viken ← Narva ← Peipus ← Emajõgi ← Võrtsjärv 1008200 20. Mustjõgi 85 994 Valgamaa, Võrumaa Rigabukten ← Gauja 1154800 21. Elva jõgi 82 451 Tartumaa, Põlvamaa, Valgamaa Finska viken ← Narva ← Peipus ← Emajõgi 1036500 22. Sauga jõgi 78 557 Pärnumaa, Raplamaa Rigabukten ← Pärnu 1148700 23. Rūja (Ruhja jõgi) 77 963 Viljandimaa Rigabukten ← Salaca Merparten i Lettland. 1153600 24. Velise jõgi 75 868 Raplamaa, Pärnumaa Moonsund ← Kasari jõgi ← Vigala jõgi 1112700 25. Narva 74 56783 Ida-Virumaa Finska viken Gränsflod till Ryssland 1062200 26. Soodla jõgi 73 222 Harjumaa, Lääne-Virumaa, Järvamaa Finska viken ← Jägala jõgi 1087000 27. Reiu jõgi 72 906 Pärnumaa Rigabukten ← Pärnu 1145400 28. Kunda jõgi 66 536 Lääne-Virumaa Finska viken 1072900 29. Vääna jõgi 64 315 Harjumaa Finska viken 1094500 30. Raudna jõgi 63 1123 Pärnumaa, Viljandimaa Rigabukten ← Pärnu ← Navesti jõgi ← Halliste jõgi 1139100 31. Ura jõgi 56 186 Pärnumaa Rigabukten 1148100 32. Rannapungerja jõgi 55 595 Ida-Virumaa Finska viken ← Narva ← Peipus 1058700 33. Kullavere jõgi 53 629 Jõgevamaa Finska viken ← Narva ← Peipus 1052600 34. Avijõgi 52 391 Lääne-Virumaa, Jõgevamaa Finska viken ← Narva ← Peipus 1056900 35. Vasalemma jõgi 50 396 Harjumaa, Raplamaa Finska viken 1099200 36. Vändra jõgi 50 255 Pärnumaa, Raplamaa, Järvamaa Rigabukten ← Pärnu 1130700
Källor Se extern länk under VEE-kod. Noter
Vattendrag